美国空军正在投入资金修复F-35战斗机外部支持系统的网络安全漏洞，这些漏洞被认为是黑客入侵F-35战斗机的最简单的入口。美国空军F-35集成办公室主管斯蒂芬·约斯特表示，F-35是一种基于软件的飞机，而任何基于软件的平台都会受到黑客的攻击。

由洛克希德·马丁公司管理的“多层安全保护”的飞机信息主干网络相对安全。但是，自主式后勤信息系统(ALIS)，基于网络的F-35飞行模拟器都可能成为黑客入侵的目标。此外，为了便于维护引入的无线应用程序也带来了必须解决的新漏洞。