F-135发动机有一个问题，为了满足垂直起降对推力的要求，有意放大了外涵道，导致发动机加速性不好，而且红外热特征更加明显。在未来的对抗中，正好可以成为霹雳-10红外格斗弹的最好目标。

而根据消息，歼-31的目标发动机是WS-19，该机已快进入高空台测试了，据业内人士称其最大推力在10吨左右，在歼-31采用两台后，最大总推力将达到20吨，一举超越F-35，超音速巡航不成问题。

疑似舰载版歼-31战斗机

在歼-31越来越成熟后，海军未必不会看上，而随着弹射型航母越来越近，中国急需一款隐身舰载机，根据前期一张模糊的照片看，疑似歼-31弹射型已现身，最明显的特征是后部的结构得到了加强，是舰载机的可能性很大。

随着歼-31的逐渐好用，五角大楼也开始表示了担忧，有官员表示，歼-31可以被改装成舰载版，这一隐藏用途使其成为了F-35在市场上的竞争对手，值得对此担忧。