在日本，眼下有越来越多的期待认为，与2011年的3·11大地震时相比，此次的熊本地震对中国人赴日旅行的影响有限。中国即将迎来五一小长假，虽然此期间部分赴九州旅游被取消，但是主力的游轮游目前没有受到太大影响。不过，也开始出现将原定春季的赴日旅行计划推迟到夏季的趋势。

据推测，2015年到访日本九州的中国人增至上年的2.8倍，达到约98万人。仅次于到访的韩国人（121万人），位居第2位。其中，约80%为游轮游。

日本3·11大地震时，受海啸和核电站事故的打击严重，即使是距离受灾地较远的九州的游轮游当时也相继被取消。但是，担心熊本地震影响的日本国土交通省九州运输局表示“此次并未出现取消和变更停泊港口的情况”。

不过，地震对以飞机为交通工具的赴日旅游产生了轻微影响。在中国，五一小长假前后是旅游旺季。日本旅游签证的审批时间约为一周，从往年来看4月第3周（18-22日）的申请数会大幅增加。不过，据向签发赴九州旅游签证较多的日本驻上海总领馆方面了解，2016年4月第3周的申请件数反而比第2周（11-15日）减少了近10%。

由于中国携程旅行网同意为退订九州旅行的游客全额退款，在熊本地震发生后1周以内，曾计划出行的游客中，80%取消了旅行。另外，在地震发生后的4月16日，中国外交部发出通知，提醒公民勿前往熊本县，近期谨慎前往九州地区。这些因素都被认为对赴九州旅游产生了一定影响。

一方面，对九州以外地区的赴日旅游的影响也很有限。据向签发赴九州旅游签证较少的日本驻北京大使馆方面了解，4月第3周的签证申请比第2周出现增加。大使馆领事部表示“只有2-3个旅行团撤销了申请”。

中国外交部发出的旅游警示为截至5月16日的1个月时间。警示解除后，夏季赴九州旅游很可能出现复苏。据日本国家旅游局表示，对于中国的旅行社来说赴日游是收入支柱，因此“部分旅行社劝说顾客将取消的4月的九州旅行改到6月份”。